ΑΡΧΑΙΟΛΟΓΙΚΟ ΜΟΥΣΕΙΟ
Το Αρχαιολογικό Μουσείο Μυκόνου βρίσκεται στη δυτική πλευρά του λιμανιού της Χώρα. Το νεοκλασικό κτίριο κτίστηκε το 1902 με σκοπό να στεγάσει τα ευρήματα από τον αρχαιολογικό χώρο της Ρήνειας.
Έτσι μπορείτε να δείτε μια σημαντική συλλογή από αγγεία των προϊστορικών μέχρι υστεροελληνιστικών χρόνων, αγάλματα και τεφροδόχους που ήρθαν στο φως από τις ανασκαφές στη νεκρόπολη της Ρήνειας καθώς και αγγεία από τη Μύκονο.
Από τα εκθέματα ξεχωρίζουν: ο αρχαϊκός αμφορέας, με τις ανάγλυφες παραστάσεις από την άλωση της Τροίας και η επιτύμβια στήλη της Τερτίας Ωραρίας, που χρονολογείται από τον 2ο π.Χ. αιώνα. Απεικονίζει μια νεκρή γυναίκα που αποχαιρετά το σύζυγό της. Η στήλη ήταν τοποθετημένη πάνω σε μια μαρμάρινη σαρκοφάγο.

ΝΑΥΤΙΚΟ ΜΟΥΣΕΙΟ ΑΙΓΑΙΟΥ
Το Ναυτικό Μουσείο Αιγαίου βρίσκεται στο κέντρο της Χώρας, στη θέση Τρία Πηγάδια. Στεγάζεται σ’ ένα κτίριο παραδοσιακής κυκλαδίτικης αρχιτεκτονικής του 19ου αιώνα. Σκοπός του μουσείου είναι να συμβάλει στη διατήρηση και προβολή της Ελληνικής ναυτικής ιστορίας και κυρίως στην εξέλιξη του εμπορικού πλοίου στον ιστορικό χώρο του Αιγαίου.
Στο μουσείο θα δείτε μια αξιόλογη συλλογή που περιλαμβάνει ομοιώματα πλοίων από τη Μινωική Εποχή μέχρι και τις αρχές του 20ου αιώνα. Επίσης, ναυτικά όργανα, εξαρτήματα και εργαλεία, νομίσματα με ναυτικές παραστάσεις από τον 5ο π.Χ μέχρι τον 5ο μ.Χ αιώνα και παλιούς χάρτες, που φανερώνουν σημαντικές πτυχές της ναυτικής πορείας των Αιγαιοπελαγίτικων νησιών.

ΛΑΟΓΡΑΦΙΚΟ ΜΟΥΣΕΙΟ
Το Λαογραφικό μουσείο της Μυκόνου βρίσκεται στην περιοχή του Κάστρου και στεγάζεται σε ένα παραδοσιακό οίκημα του 18ου αιώνα. Φιλοξενεί μια αξιόλογη συλλογή από τοπικές ενδυμασίες, υφαντά, εργαλεία και οικοσκευές περασμένων εποχών, έπιπλα, κεραμικά αντικείμενα και ένα σημαντικό αρχείο από φωτογραφίες και ιστορικά έγγραφα.