Το Αρχαιολογικό μουσείο της Ίου βρίσκεται στη Χώρα και στεγάζεται σ’ ένα μεγαλοπρεπές νεοκλασικό κτίριο, το Αμοιραδάκειο Μέγαρο.
Για την ιστορία αναφέρουμε ότι η πρώτη Αρχαιολογική συλλογή στη Ίο δημιουργήθηκε το 1904 με ενέργειες του δημάρχου Φραγκούλη Κορτέση. Στις αρχές της δεκαετίας του 1980, όταν άρχισαν οι ανασκαφές, η ανάγκη δημιουργίας μουσείου έγινε επιτακτική. Έτσι, ιδρύθηκε το Αρχαιολογικό μουσείο της Ίου, στο οποίο εκτίθενται όλα τα σημαντικά ευρήματα που μας βοηθούν να ξεδιπλώσουμε την ιστορία του νησιού.
Στις τέσσερις αίθουσες του μουσείου φιλοξενούνται ισάριθμες θεματικές ενότητες. Αναλυτικότερα στην αίθουσα 1, παρουσιάζεται το φυσικό περιβάλλον της Ίου και η ιστορία της αρχαιολογικής έρευνας στο νησί. Ο υπόλοιπος εκθεσιακός χώρος είναι αφιερωμένος στην πρωτοκυκλαδική εποχή. Θα δείτε τα ευρήματα των ανασκαφών στον οικισμό του Σκάρκου και θα πληροφορηθείτε για την κοινωνική οργάνωση και την πολεοδομική και αρχιτεκτονική μορφή της σημαντικής αυτής αρχαίας αυτής πόλης. Από τα εκθέματα ξεχωρίζουν τα κεραμικά σκεύη, τα εδώλια, τα εργαλεία και τα οστά ζώων.
Στην αίθουσα 2, παρουσιάζεται η ιστορία του νησιού κατά τη Μέση και Ύστερη εποχή του Χαλκού. Τα εκθέματα προέρχονται κυρίως από τις ανασκαφές στο νεκροταφείο του Σκάρκου.
Στις αίθουσες 3 και 4, φιλοξενούνται ευρήματα που χρονολογούνται από τους ιστορικούς χρόνους. Συγκεκριμένα, ανήκουν χρονικά στην Αρχαϊκή περίοδο και στην Ύστερη Αρχαιότητα. Τα εκθέματα αυτά προέρχονται από την αρχαία πόλη της Ίου. Ξεχωρίζει η συλλογή με τις επιγραφές και οι επιτύμβιες στήλες.
Στο μουσείο εκτός από τις μόνιμες εκθέσεις φιλοξενούνται και περιοδικές εκθέσεις.