Το Αρχαιολογικό Μουσείο της Σάμου βρίσκεται στο Βαθύ, την πρωτεύουσα του νησιού και στεγάζεται σε δύο κτίρια.
Το παλιό μουσείο, το ΄΄Πασχάλειο Αρχαιοφυλάκειον΄΄, το οποίο στεγάζεται σ΄ ένα οίκημα που κτίστηκε το 1912 και το Νέο Μουσείο, το οποίο κτίστηκε το 1987 με σκοπό να στεγάζει τα σημαντικά αρχαιολογικά ευρήματα.
Και στα δύο κτίρια φιλοξενούνται αξιόλογα συλλογές και μοναδικά ευρήματα που προέρχονται από τους αρχαιολογικούς χώρους του νησιού.
Ιδιαίτερα εντυπωσιακή είναι η συλλογή με τα αρχαϊκά γλυπτά.
Επίσης, από τα εκθέματα των μουσείων ξεχωρίζουν: ο Κολοσικός Κούρος, ύψους 5,50 μ. που χρονολογείται από τον 6ο π.Χ. αιώνα. Το μαρμάρινο άγαλμα ντυμένης γυναικείας μορφής που χρονολογείται από το 560 π.Χ. Το αγαλματίδιο ιππέα, ύψους 0,20 μ. Χαρακτηριστικό του είναι ότι τα μάτια του ήταν ένθετα. Χρονολογείται από το 530 π.Χ. Ο πήλινος αρχαϊκός κέρνος, που είναι διακοσμημένος με μικρογραφικά αγγεία και εδώλια του 7ου π.Χ. αιώνα.