Η Σχοινούσα έχει καθημερινή σύνδεση με τον Πειραιά μέσο της γραμμής: Πάρος – Νάξος – Ηράκλεια – Σχοινούσα – Κουφονήσια – Κατάπολα.
Επίσης, το νησί συνδέεται με τη Νάξο με τοπικά δρομολόγια.
Για περισσότερες πληροφορίες:
ΛΙΜΕΝΑΡΧΕΙΟ ΠΕΙΡΑΙΑ 210 4226000 – 4
ΛΙΜΕΝΑΡΧΕΙΟ ΣΧΟΙΝΟΥΣΑΣ 22720 55394
ΛΙΜΕΝΑΡΧΕΙΟ ΝΑΞΟΥ 22850 22300