Η Απολλώνια ή Πολώνια είναι ένα μικρό ψαροχώρι κτισμένο γύρω από ένα γραφικό κόλπο. Βρίσκεται στην ανατολική πλευρά του νησιού, σε απόσταση 14 χλμ. από την Πλάκα. Λόγο της φυσικής ομορφιάς του τόπου και των αρχαιοτήτων που βρίσκονται στη περιοχή, η Απολλώνια έχει εξελιχθεί σ’ ένα άρτια οργανωμένο τουριστικό κέντρο και είναι ιδιαίτερα δημοφιλής στους επισκέπτες του νησιού. Κοντά στον οικισμό, στο δρόμο Αδάμαντα – Απολλώνια, βρίσκονται τα ερείπια της αρχαίας πόλης Φυλακωπής, η οποία – σύμφωνα με τα ευρήματα – άκμασε σε τρεις διαφορετικές χρονικές περιόδους. Στην ίδια περιοχή, πολύ κοντά στον αρχαιολογικό χώρο, βρίσκεται και η σπηλιά του Παπαφράγκα. Ένα από τα διασημότερα φυσικά αξιοθέατα του νησιού. Τρεις σπηλιές με λευκά βράχια λαξεμένα από τα κύματα, μοναδικά με έργα τέχνης που μόνο η φύση ξέρει να δημιουργεί. Από το λιμανάκι της Απολλώνιας εκτελούνται και δρομολόγια προς τη γειτονική Κίμωλο.