Στην νότια πλευρά του νησιού βρίσκεται το μικρό παραθαλάσσιο χωριό Μαραθώνας. Ξεχωρίζει για την υπέροχη αμμουδιά του και την καθάρια παραλία με τα κρυστάλλινα καταγάλανα νερά.
Εκπληκτική είναι και η θέα του καθώς από τον Μαραθώνα αγναντεύει κανείς μέχρι και τα επιβλητικά βουνά της Πελοποννήσου. Χάρη στην απίστευτη ομορφιά της περιοχής, η παραλία του Μαραθώνα θεωρείται μια από τις ωραιότερες της Αίγινας και συγκεντρώνει μεγάλο αριθμό επισκεπτών.